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中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析


网上娱乐网站排行榜   发布时间: 2019-01-16   信息员:  


中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析.pdf


作者:睿,李龙,熊翠玲,郑燕珍,付中民,王海朋,赵红霞,陈大福


摘要:基于前期已获得的中华蜜蜂( 简称中蜂) 幼虫肠道转录组数据,利用 TopHat2 软件在正常( AcCK) 及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品( AcT1AcT2AcT3) 中共鉴定出发生于 9124个基因的 57327 个可变剪切事件,其中以基因间( 1768%) 、可变 3'端剪切( 1532%) 、外显子跨越( 1412%) 和可变 5'端剪切( 1281%) 类型为主.Venn 分析结果显示 4 个肠道样品的共有可变剪切基因数为 8111 个,特有可变剪切基因数分别为 272189  385 个.GO 分类结果显示共有可变剪切基因涉及 47 个条目,AcT1AcT2AcT3 的特有可变剪切基因分别富集于 2420 34 个条目.KEGG 代谢通路富集分析结果显示,共有可变剪切基因富集在 327 个代谢通路,基因富集数最多的是 RNA 转运、内质网蛋白加工及核糖体; AcT1AcT2AcT3 的特有可变剪切基因分别富集在 2246  83 个代谢通路.结果揭示了可变剪切基因在宿主的胁迫响应过程中的重要作用.


关键词: 中华蜜蜂; 幼虫肠道; 球囊菌; 胁迫; 可变剪切


发表信息:四川大学学报(自然科学版), 2018, 55(6): 1313-1318


 
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